Pokud bylo vypadnutí Slavie v předcházející sezoně na hřišti druholigové Čáslavi překvapením, tento ročník nabídl skutečný šok. Sešívaní, v té době účastník základní skupiny Ligy mistrů a budoucí ligový šampion, nestačili opět ve třetím kole na divizní Líšeň, které podlehli 3:4. Líšeň pak v osmifinále nepřešla přes Viktorii Žižkov. Ročník 2007/2008 pak přinesl další novinku hracího systému, když se po vzoru některých dalších evropských soutěží, začalo hrát od čtvrtfinále dvoukolovým pohárovým systémem doma/venku. S tímto novým systémem se nejlépe sžila Sparta, která dvakrát porazila HFK Olomouc i Bohemians Praha a ve finále, které opět hostil Strahov, tentokrát po penaltovém rozstřelu vyzrála na Liberec.